Guanidin tiyosiyanat ve guanidin hidroklorür arasındaki temel fark, guanidin tiyosiyanatın RNA izolasyonunda daha yaygın olarak kullanılan daha güçlü bir protein denatüran olması, guanidin hidroklorürün ise RNA izolasyonunda daha az kullanılan daha zayıf bir protein denatüran olmasıdır.
Denatürasyon, proteinlerin doğal hallerinde normalde mevcut olan kuaterner yapılarını, üçüncül yapılarını ve ikincil yapılarını kaybetme sürecidir. Güçlü bir asit veya baz, konsantre bir inorganik tuz, bir organik çözücü (alkol, kloroform), çalkalama, radyasyon veya ısı gibi bazı dış stres veya bileşiklerin uygulanmasıyla yapılabilir. Guanidin tiyosiyanat ve guanidin hidroklorür, iki farklı protein denaturant türüdür.
Guanidin Tiyosiyanat nedir?
Guanidin tiyosiyanat (GTC), RNA izolasyonunda daha yaygın olarak kullanılan daha güçlü bir protein denatüre edici ajandır. Ayrıca guanidinyum izotiyosiyanat (GITC) olarak da bilinir. Kaotropik bir ajan olarak, genel bir protein denaturantı olarak rutin olarak kullanılan kimyasal bir bileşiktir. Bir kaotropik ajan, su molekülleri arasındaki hidrojen bağ ağını bozabilen bir su çözeltisindeki bir moleküldür. Bu, hidrofobik etkiyi zayıflatarak, proteinler ve nükleik asitler gibi makromoleküller gibi çözeltideki diğer moleküllerin doğal durumunun stabilitesi üzerinde bir etkiye sahiptir. Guanidin tiyosiyanat gibi kaotropik ajanlar, su moleküllerinin hem yığın halinde hem de hidrofobik amino asitlerin etrafındaki hidrasyon kabuklarında oluşturdukları protein yapısındaki düzen miktarını az altır. Bu, protein denatürasyonuna neden olabilir.
Guanidin tiyosiyanat, 1918'deki İspanyol gribi gibi hastalıklara neden olan grip gibi virüsleri etkisiz hale getirmek için kullanılabilir. Bu nedenle tıbbi veya hastane kurulumlarında kullanılabilir. Ayrıca Guanidin tiyosiyanat, RNA ve DNA ekstraksiyonlarında hücreleri ve virüs partiküllerini parçalamak için de kullanılır. Burada, guanidin tiyosiyanatın işlevi, parçalama eylemine yardımcı olmak ve denatüre ederek RNaz enzimlerinin ve DNaz enzimlerinin aktivitesini önlemektir. Aksi takdirde bu enzimler ekstrakta (RNA veya DNA) zarar verir.
Guanidin Hidroklorür Nedir?
Guanidin hidroklorür (GdnHCl), RNA izolasyonunda daha az kullanılan daha zayıf bir protein denatüranıdır. Ayrıca guanidinyum klorür (GdmCl) olarak da bilinir. Guanidinin hidroklorür tuzudur. Guanidin hidroklorür kaotropiktir ve protein katlanmasının fizikokimyasal çalışmalarında kullanılan denaturantlardan biridir.
Şekil 01: Guanidin Hidroklorür
Guanidin hidroklorür ayrıca enzim aktivitesini az altma ve hidrofobik moleküllerin çözünürlüğünü artırma yeteneğine de sahiptir. Normalde, daha yüksek guanidin hidroklorür konsantrasyonlarında, proteinler düzenli yapılarını kaybeder. Proteinler, bu guanidin hidroklorür konsantrasyonunda rastgele kıvrılma eğilimindedir. Tıbbi veya hastane kurulumlarında, Eaton-Lambert sendromu hastalığı ile ilişkili kas zayıflığı ve kolay yorulma semptomlarının az altılması için guanidin hidroklorür endikedir. Ayrıca, guanidin hidroklorür kullanmanın yan etkileri arasında peristalsis, ishal ve ölümcül kemik iliği baskılanması sayılabilir.
Guanidin Tiyosiyanat ve Guanidin Hidroklorür Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Guanidin tiyosiyanat ve guanidin hidroklorür, iki farklı protein denaturant türüdür.
- Her iki denaturantın yapısında guanidin vardır.
- Onlar kaotropik ajanlardır.
- Her iki denaturant RNA izolasyonu için kullanılabilir.
- Her ikisi de tıbbi veya hastane kurulumlarında kullanılır.
Guanidin Tiyosiyanat ve Guanidin Hidroklorür Arasındaki Fark Nedir?
Guanidin tiyosiyanat, RNA izolasyonunda daha yaygın olarak kullanılan daha güçlü bir protein denatüran ajan iken, guanidin hidroklorür, RNA izolasyonunda daha az kullanılan daha zayıf bir protein denatürandır. Dolayısıyla, bu guanidin tiyosiyanat ve guanidin hidroklorür arasındaki temel farktır. Ayrıca, guanidin tiyosiyanatın kimyasal formülü C2H6N4S iken, kimyasal formülü guanidin hidroklorürün değeri CH5N3HCl'dir.
Aşağıdaki infografik, yan yana karşılaştırma için guanidin tiyosiyanat ve guanidin hidroklorür arasındaki farkları tablo halinde sunar.
Özet – Guanidin Tiyosiyanat vs Guanidin Hidroklorür
Guanidin tiyosiyanat ve guanidin hidroklorür, iki farklı protein denaturant türüdür. Her iki denaturant da kaotroptur. Guanidin tiyosiyanat, RNA izolasyonunda daha yaygın olarak kullanılan daha güçlü bir protein denatüran ajan iken, guanidin hidroklorür, RNA izolasyonunda daha az kullanılan daha zayıf bir protein denaturanttır. Bu, guanidin tiyosiyanat ve guanidin hidroklorür arasındaki farkı özetler.
