DNA ve cDNA arasındaki temel fark, DNA'nın hem ekzonları hem de intronları içermesi, cDNA'nın ise yalnızca eksonları içermesidir.
DNA ve cDNA, deoksiribonükleo titlerden oluşan iki tür nükleik asittir. DNA, genomu oluşturan canlı organizmaların en önemli makromoleküllerinden biridir. Genom, bir organizmanın genel genetik bilgisini içerir. Kodlayıcı diziler olan eksonlar ve kodlamayan diziler olan intronlar dahil olmak üzere farklı dizi türlerini oluşturur. Öte yandan, cDNA veya tamamlayıcı DNA, bilim adamları tarafından mRNA moleküllerinden yapay olarak sentezlenen başka bir DNA şeklidir.cDNA, mRNA şablonlarından türetildiği için, kodlamayan diziler veya intronlar içermez.
DNA nedir?
Deoksiribonükleik asit veya DNA, bakteriler dahil birçok canlı organizmanın genetik materyali olarak hizmet eder. Genetik bilgi, DNA moleküllerinde nükleotid dizileri ve genler şeklinde bulunur. Üreme sırasında ebeveyn DNA'sı, gametler yoluyla yavru kuşağına iletir. Yapısal olarak DNA, deoksiribonükleo titlerin monomerlerinden oluşan bir makromoleküldür. Deoksiribonükleotidin üç bileşeni vardır; deoksiriboz şeker, azotlu bir baz (adenin, guanin, sitozin ve timin) ve bir fosfat grubu. Ayrıca, DNA molekülleri, tamamlayıcı azotlu bazlar arasındaki hidrojen bağlarıyla bağlanan iki tamamlayıcı DNA dizisinden yapılmış çift sarmal olarak bulunur. Buna göre adenin ile timin arasında iki hidrojen bağı, sitozin ile guanin arasında üç hidrojen bağı vardır.
Şekil 01: DNA
DNA sarmalında, fosfat ve şeker kısımları sarmalın dışında yer alırken bazlar sarmalın içinde kalır. İki DNA dizisi zıt yönlerde çalışır. Ayrıca DNA molekülleri, histon proteinleri ile sıkıca sarılır ve ökaryotlarda kromozom adı verilen iplik benzeri yapılar oluşturur. DNA'nın önemli bir özelliği, kendini kopyalayabilmesidir, yani kendini kopyalayabilir veya kopyalayabilir. Ayrıca canlı organizmaların protein sentezinde de önemli bir role sahiptir.
cDNA nedir?
cDNA tamamlayıcı DNA anlamına gelir. Revers transkriptaz enzimi varlığında şablon görevi gören haberci RNA (mRNA) tarafından yapay olarak sentezlenen bir DNA formudur. Çoğu ökaryotta genomik DNA, ekzon ve intronlardan oluşan birçok gen içerir. Eksonlar kodlama dizileridir, intronlar ise genomun kodlamayan kısmını oluşturur. Genel olarak, gen ekspresyonu sırasında, bir protein üretmeden önce duyu DNA dizisi bir mRNA dizisine kopyalanır. Olgun bir mRNA oluştururken, bir ekleme mekanizması tüm intron dizilerini kaldırır. Bu nedenle, olgun mRNA, intronları veya kodlamayan dizileri içermez.
Ayrıca ökaryotik hücrelerin mRNA'sı cDNA yapmak için ekstrakte edilebilir ve saflaştırılabilir. enzim; ters transkriptaz, bu saflaştırılmış ökaryotik mRNA'dan cDNA sentezini katalize eder. mRNA'dan cDNA oluşturulduktan sonra, cDNA kitaplıkları oluşturmak için bir bakteri hücresine klonlanabilirler veya heterolog ekspresyon çalışmaları yapmak için kullanılabilirler.
Şekil 02: cDNA
Genellikle cDNA, prokaryotlarda ökaryotik genlerin klonlanmasında büyük bir değere sahiptir. Prokaryotlar intron içermediğinden ökaryotik DNA'dan intronları çıkaramaz ve fonksiyonel mRNA yapamazlar. Bu nedenle bütün ökaryotik genleri prokaryotlara klonlamadan önce intronları çıkarmak ve mRNA'dan cDNA yapmak ve prokaryotlara klonlamak gerekir.
DNA ve cDNA Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- DNA ve cDNA, nükleik asitlerin iki şeklidir.
- Her ikisi de deoksiribonükleotid monomerleri içerir.
- Ayrıca, her ikisi de genlerin kodlama dizilerine sahiptir.
DNA ve cDNA Arasındaki Fark Nedir?
DNA, nükleik asidin doğal bir şeklidir, cDNA ise yapay olarak oluşturulmuş bir nükleik asit şeklidir. Bu nedenle, bu DNA ve cDNA arasındaki bir farktır. Ayrıca DNA, birçok canlı organizmanın genomunu temsil eder. Kodlayan ve kodlamayan dizileri oluşturur. Ancak mRNA yapılırken, proteinlerin oluşumu için önemli olmadıkları için tüm intron dizileri eksize edilir. Bu nedenle, mRNA dizileri intron içermez. Bu mRNA dizileri, cDNA sentezlenirken şablon görevi görür. Bu nedenle, cDNA intron içermez. Buna göre, DNA intron içerir, ancak cDNA intron içermez. Bunu DNA ve cDNA arasındaki temel fark olarak söyleyebiliriz.
Ayrıca, cDNA yalnızca ekzon içerdiğinden, cDNA'lar DNA'dan çok daha kısadır. DNA, binlerce baz çiftini kapsayan bazı intronlar içerir. Yani, bu aynı zamanda DNA ve cDNA arasındaki bir farktır. Ayrıca, DNA doğal olarak çift sarmallı sarmal olarak oluşurken cDNA tek sarmallı diziler halinde oluşur. DNA polimeraz, DNA sentezini veya replikasyonunu katalize eden enzimdir, ters transkriptaz ise laboratuarda cDNA sentezini katalize eden enzimdir.
DNA ve cDNA arasındaki farkla ilgili aşağıdaki bilgi grafiği, bu farklılıklar hakkında daha fazla ayrıntı sağlar.
Özet – DNA vs cDNA
DNA, genomumuzu oluşturan önemli bir polimerdir. Öte yandan, cDNA, cDNA kitaplıkları oluşturmak ve zor ifade edilen proteinler üretmek için önemli olan başka bir DNA şeklidir. mRNA, cDNA yapmak için kullanılır. Bu nedenle, cDNA intron içermez. Ancak DNA intronlar içerir. Bu nedenle, DNA ve cDNA arasındaki temel farktır. DNA, genomik DNA kitaplıkları oluşturmak için yararlıdır, cDNA ise cDNA kitaplıkları oluşturmak için yararlıdır. cDNA intron içermediği için cDNA, DNA'dan daha kısadır. En önemlisi, DNA çift sarmallı iken cDNA tek sarmallıdır. Bu, DNA ve cDNA arasındaki farkı özetler.
