CDS ve cDNA arasındaki temel fark, CDS veya kodlama dizisinin, aslında proteine çevrilen bir transkriptin parçası olmasıdır, cDNA dizisi ise ters transkripsiyon yoluyla mRNA'dan türetilen bir DNA dizisidir.
Bir gen, bir proteini kodlayan bir nükleotid dizisidir. Promotör bölge, transkripsiyon başlama bölgesi, ekzonlar, başlatma kodonu, intronlar ve durdurma kodonu gibi farklı bölgelerden oluşur. Bu nedenle, bir genin hem kodlayan hem de kodlamayan dizileri vardır. Kodlama dizileri veya CDS, eksonları ve başlatma kodonu ve durdurma kodonu olan iki kodonu belirtir. Aslında bir proteine çevrilen dizilimdir. Buna karşılık, cDNA, ters transkripsiyon yoluyla mRNA'dan türetilen bir DNA dizisidir.
CDS nedir?
CDS veya kodlama dizisi, aslında bir proteine çevrilen bir genin parçasıdır. AUG kodonu ve stop kodonu olmak üzere ekzon ve iki kodondan oluşur. CDS, cDNA'nın aksine, çevrilmemiş iki bölge içermez: 5' UTR ve 3 UTR. Ayrıca intronlar CDS'ye dahil değildir.
Şekil 01: Kodlama Sırası
Tüm genom ve bir bireyle karşılaştırıldığında, kodlama dizileri küçük bir kesirdir. Kodlama dizisi, proteinin amino asit dizisini yapmak için gerekli nükleotid dizisinden oluşur.
cDNA nedir?
cDNA veya tamamlayıcı DNA, mRNA dizisinden oluşturulan bir DNA dizisidir. Ters transkripsiyon adı verilen işlemle sentezlenir. Enzim ters transkriptaz, cDNA sentezini katalize eder ve mRNA dizisi, cDNA sentezi için şablon görevi görür. Temel olarak, ökaryotik hücrelerin mRNA'sı, cDNA yapmak için ekstrakte edilebilir ve saflaştırılabilir. mRNA'dan cDNA oluşturulduktan sonra, cDNA kitaplıkları yapmak için bir bakteri hücresine klonlanabilirler. cDNA kütüphaneleri, kodlama bölgelerinin, gen fonksiyonlarının ve genlerin ekspresyonunun vb. analizi için önemlidir.
Şekil 02: cDNA
Kodlama dizisinden farklı olarak cDNA, 3' UTR ve 5' UTR olmak üzere iki UTR içerir. Kodlama dizisine benzer şekilde, cDNA intron içermez.
CDS ve cDNA Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- CDS ve cDNA nükleik asitlerdir.
- Deoksiribonükleo titlerden yapılırlar.
- Hem CDS hem de CDNA, kodlamayan bölgeler olan intronları içermez.
- Her ikisi de bir protein üretmek için genetik kodu veya bilgiyi içerir.
CDS ve cDNA Arasındaki Fark Nedir?
CDS veya kodlama dizisi, bir genin aslında bir proteine çevrilmiş kısmıdır. Öte yandan, cDNA dizisi, mRNA'dan ters transkripsiyon yoluyla türetilen bir DNA dizisidir. Bu, CDS ve cDNA arasındaki temel farktır. Ayrıca CDS, eksonlar ve başlama kodonu ve durdurma kodonu olan iki kodondan oluşur. Buna karşılık, cDNA, tam mRNA dizisinden ve iki UTR'den oluşur.
Ayrıca, CDS genomik DNA'da bulunurken, cDNA sentezi ters transkripsiyon yoluyla mRNA'dan yapay olarak yapılır.
Aşağıdaki infografik, CDS ve cDNA arasındaki farkı ayırt etmek için daha fazla karşılaştırma gösteriyor.
Özet – CDS ve cDNA
Kodlama dizisi ve cDNA, iki tür nükleotit dizisidir. Kodlama dizisi bir gen içinde bulunurken cDNA yapay olarak sentezlenir. Kodlama dizisinde eksonlar ve iki kodon bulunurken cDNA'da bir mRNA dizisi ve iki UTR bulunur. Hem CDS hem de cDNA, yalnızca bir proteine dönüşen nükleotid dizilerine sahiptir. İntron içermezler. CDS'den farklı olarak cDNA sentez işlemi, ters transkriptaz enzimi gerektirir. Ayrıca cDNA, cDNA kitaplıklarına dönüşebilir. Böylece, bu CDS ve cDNA arasındaki farkı özetler.
