ORF ve ekson arasındaki temel fark, ORF veya açık okuma çerçevesinin, translasyon başlatma bölgesi (başlangıç kodonu) ile başlayan ve ekson amino asitleri kodlayan bir gen içindeki bir nükleotid dizisi.
Açık okuma çerçevesi, okuma çerçevesinin bir parçasıdır. Okuma çerçeveleri, proteinleri yapmak için ribozomlar tarafından okunur. ORF, tamamen işlevsel bir protein veren sürekli bir kodon dizisidir. Bir başlatma kodonu ile başlar ve bir durdurma kodonu ile sona erer. ORF'nin içinde kodlama dizisini kesintiye uğratan bir durdurma kodonu yoktur. Translasyon başlangıç kodonunda başlar ve bitiş kodonunda biter. Ekson, bir genin nükleotid dizisidir. Proteinin amino asitlerini kodlar. Bu nedenle ekzonlar bir genin kodlama bölgeleridir.
ORF nedir?
Açık okuma çerçevesi veya ORF, bir başlangıç kodonu ile başlayan ve bir durdurma kodonu ile biten bir nükleotid dizisinin sürekli uzantısıdır. Basit bir deyişle, ORF, başlangıç ve bitiş kodonları arasında yer alan nükleotit dizisi bölgesini ifade eder. Arada, ORF'yi kesintiye uğratan bir durdurma kodonu yoktur. Başlangıç ve bitiş kodonu arasındaki nükleotid dizisi, amino asitleri kodlar. Genellikle başlangıç kodonu ATG iken durdurma kodonları TAG, TAA ve TGA'dır. ORF, kopyalandığında ve çevrildiğinde işlevsel bir protein verir. Bu nedenle ORF, bir başlangıç kodonu, orta bölgede birkaç kodon ve bir durdurma kodonu içerir. İlginçtir ki, ORF üçe bölünebilen bir uzunluğa sahiptir.
Şekil 01: ORF
Prokaryotlarda intron olmadığı için ORF, doğrudan mRNA'ya kopyalanan bir genin kodlama bölgesidir. Ökaryotlarda, intronlar olduğu için ORF, işlemden veya RNA eklemeden sonra ortaya çıkan kodon dizisidir. ORF, uzun ORF'lerin bir genin parçası olması muhtemel olduğundan, gen tahminine yardımcı olan bir kanıttır.
Ekson nedir?
Eksonlar, proteinlere dönüşen genlerin kodlayan nükleotid dizileridir. Bir intronun her iki tarafında bulunurlar. Ön mRNA'dan kodlamayan diziler çıkarıldıktan sonra, olgun mRNA molekülü yalnızca ekson dizilerinden oluşur. Daha sonra nihai RNA molekülünün (olgun mRNA) nükleotid dizisi, belirli bir proteinin amino asit dizisine dönüşür.
Şekil 02: Eksonlar
Neredeyse tüm genler, onu bir gen olarak, Açık Okuma Çerçevesi (ORF) olarak bilinen ana DNA veya RNA zincirinden ayıran bir başlangıç nükleotid dizisine sahiptir. Bazı genlerde, iki ORF, tüm geni ve ekzonları işaretler. Ekzonların her zaman genlerde eksprese edildiği gibi görünse de, intron dizilerinin ekson ile etkileşime girerek mutasyonlara neden olduğu durumlar vardır ve bu süreç eksonizasyon olarak bilinir.
ORF ve Exon Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Hem ORF hem de ekson nükleotid dizileridir.
- Uzun ORF ve ekzonlar bir genin parçalarıdır.
- İkisinin de kodlama dizisi var.
ORF ve Exon Arasındaki Fark Nedir?
ORF ve ekson nükleotid dizileridir. ORF, bir başlangıç kodonu ile bir durdurma kodonu arasında yer alan herhangi bir DNA dizisi uzantısını ifade eder. Buna karşılık, ekson, amino asitleri kodlayan bir genin kodlayıcı bir nükleotid dizisidir. Dolayısıyla, bu ORF ve ekson arasındaki temel farktır. Ekzonlar bir genin parçaları iken, uzun ORF'nin bir genin parçası olması muhtemeldir. Ayrıca, bir eksonun her iki tarafında da intronlar bulunurken ORF, intronları içermez.
Aşağıdaki infografik, ORF ve ekson arasındaki farkı tablo şeklinde özetler.
Özet – ORF ve Exon
Açık okuma çerçevesi (ORF), okuma çerçevesinin bir parçasıdır. Bir başlangıç kodonu ile başlayan ve bir durdurma kodonu ile sona eren DNA dizisinin sürekli uzantısıdır. Ekson, bir genin nükleotid dizisidir. mRNA dizisinin bir bölümünü kodlar. Bu nedenle ekzonlar, proteinde ifade edilen gen dizisinin parçalarıdır. Böylece, bu ORF ve ekson arasındaki farkı özetler.
