ssRNA ve dsRNA arasındaki temel fark, ssRNA'nın yalnızca bir RNA dizisine sahip olması, dsRNA'nın ise iki tamamlayıcı siRNA veya miRNA dizisinden oluşmasıdır.
RNA veya ribonükleik asit, ribonükleo titlerden oluşan bir nükleik asit türüdür. Genel olarak, RNA, DNA çift sarmalının aksine, tek sarmallı bir moleküldür. Virüslerin B altimore sınıflandırmasında Grup III, Grup IV ve Grup V, RNA virüslerini içerir. Bazı virüslerin bir ssRNA veya tek sarmallı RNA genomu vardır. Bu nedenle, genomları bir RNA dizisinden yapılır. Ayrıca, bazı virüsler dsRNA veya çift sarmallı RNA genomuna sahiptir. Bu nedenle, genomları iki tamamlayıcı RNA dizisinden yapılır. Sükroz veya sezyum klorür yoğunluk gradyan tekniği, ssRNA virüslerini ve dsRNA virüslerini ayırabilir. Daha hafif parçacıklar ssRNA virüsleridir, daha yoğun parçacıklar ise dsRNA içerir.
ssRNA nedir?
ssRNA, tek sarmallı RNA anlamına gelir. Genel olarak, RNA tek sarmallıdır. ssRNA genomuna sahip virüsler vardır. Bunlar iki tiptir: RNA'nın duyusuna veya polaritesine dayanan pozitif duyu ve negatif duyu. Pozitif anlamda tek sarmallı RNA, mRNA gibi davranır. Bu nedenle, doğrudan bir proteine dönüşebilir. Negatif anlamda ssRNA, mRNA'yı tamamlayıcıdır. Bu nedenle, RNA'ya bağımlı RNA polimeraz tarafından pozitif anlamda ssRNA'ya dönüştürülmelidir. Ondan sonra bir proteine dönüşebilir.
Şekil 01: RNA Virüsleri
B altimore sınıflandırmasında, pozitif anlamda ssRNA virüsleri Grup IV'e aitken, negatif anlamda ssRNA virüsleri Grup V'e aittir. Sükroz veya sezyum klorür yoğunluk gradyanlarında, daha hafif parçacıklar ssRNA virüsleri içerir.
dsRNA nedir?
dsRNA, çift sarmallı RNA anlamına gelir. dsRNA'da birbirini tamamlayan iki RNA dizisi vardır. Bu iplikler, tamamlayıcı bazlar arasında bağlar oluşturarak birbirleriyle eşleştirilir. ssRNA'nın aksine, dsRNA uzun değildir – kısa bir moleküldür. dsRNA, tamamlayıcı DNA zincirleri, karşıt promotörlerden simetrik transkripsiyon yoluyla RNA'ya kopyalandığında oluşur. Ayrıca ssRNA, tamamlayıcı baz eşleşmesi yoluyla dsRNA olan sarmal içi çift sarmallar oluşturabilir. dsRNA, transpozonlardan ve tekrarlayan genlerden kaynaklanan tamamlayıcı ssRNA'ların baz eşleşmesiyle de oluşturulabilir.
Şekil 02: dsRNA Virüsü
Bazı virüslerin dsRNA genomları vardır. Bu virüslerin geniş bir konak aralığı vardır. Rotavirüsler ve pikobirnavirüsler dsRNA virüsleridir. Bu virüslerin dsRNA genomu, RNA'ya bağımlı RNA polimeraz tarafından mRNA'ya kopyalanır. Daha sonra mRNA molekülleri viral proteinlere dönüşür. Ayrıca, pozitif anlamda RNA ipliği, yeni viral partiküller için dsRNA genomları üretmek üzere tekrar kullanılabilir. B altimore sınıflandırmasında dsRNA, Grup III'e aittir. dsRNA virüsleri memeliler, bakteriler, bitkiler ve mantarlar dahil tüm organizmaları enfekte eder.
Küçük enterferans yapan RNA veya siRNA, ökaryotlarda RNA enterferansını ve ayrıca omurgalılarda interferon tepkisini tetikleyebilen bir dsRNA türüdür.
ssRNA ve dsRNA Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- ssRNA ve dsRNA'ya sahip virüsler var.
- Tek sarmallı bir RNA molekülü, dsRNA olan sarmal içi çift sarmallar oluşturmak için tamamlayıcı baz eşleşmesinden geçebilir.
- Hem ssRNA hem de dsRNA, dört baza sahip ribonükleo titlerden yapılır; adenin(A), sitozin (C), guanin (G) veya urasil (U), bir riboz şekeri ve bir fosfat grubu.
ssRNA ve dsRNA Arasındaki Fark Nedir?
ssRNA ve dsRNA arasındaki temel fark, ssRNNA'nın yalnızca bir sarmalına sahip olması, dsRNA'nın ise birlikte eşleştirilmiş iki tamamlayıcı RNA sarmalına sahip olmasıdır. Doğada ssRNA bol miktarda bulunurken dsRNA daha az bulunur. B altimore sınıflandırmasında ssRNA virüsleri Grup IV ve V'de iken dsRNA virüsleri Grup III'tedir.
Aşağıdaki infografik, ssRNA ve dsRNA arasındaki farkı tablo şeklinde gösterir.
Özet – ssRNA vs dsRNA
Doğada RNA, kendi üzerine katlanmış tek sarmallı bir molekül olarak bulunur. mRNA, ribozomlar üzerinde bir proteine dönüşen tek sarmallı RNA molekülüdür. Birçok virüsün RNA genomları vardır. Bazı virüsler ssRNA genomlarına sahipken, bazı virüsler dsRNA genomlarına sahiptir. dsRNA, birlikte eşleştirilmiş iki tamamlayıcı RNA zincirine sahiptir. Pozitif sens ssRNA, doğrudan mRNA olarak hareket eder ve viral proteinlere dönüşürken, negatif sens ssRNA, RNA'ya bağlı RNA polimeraz tarafından pozitif anlamda ssRNA'ya dönüştürülür ve daha sonra proteinlere çevrilir. dsRNA, RNA'ya bağımlı RNA polimeraz tarafından mRNA'ya kopyalanır ve ardından mRNA molekülleri viral proteinlere çevrilir. Böylece, bu ssRNA ve dsRNA arasındaki farkı özetler.
