Koşullu ve yapısal nakavt arasındaki temel fark, koşullu nakavt, ilgilenilen bir genin belirli bir doku veya organdan silinmesi iken yapıcı nakavt, ilgili bir genin hayvandan kalıcı olarak silinmesidir.
Fare, benzer genlerin yaklaşık %99'unu paylaştığı için çoğu insan biyolojik süreci için iyi bir analogdur. Nakavt fareler yararlı deney hayvanlarıdır ve araştırmalarda obezite, kalp hastalığı, diyabet, artrit, madde bağımlılığı, anksiyete, yaşlanma ve Parkinson hastalığı gibi farklı kanser türlerini ve insan hastalıklarını incelemek için kullanılırlar. Nakavt fareler, işlevsel olarak inaktive edilmiş bir ilgi geni olan genetiği değiştirilmiş organizmalardır. Genin nakavt edilmesi, değiştirilerek veya etkisiz hale getirmek için yapay bir DNA parçası eklenerek yapılabilir. Nakavt fareler, genlerin işlevleri hakkında değerli bilgiler sağlar. Kurucu (geleneksel) ve koşullu olmak üzere iki nakavt modeli vardır. Yapıcı modelde, hedef gen tüm hayvanlarda tüm zamanlar için kalıcı olarak inaktive edilir. Koşullu modelde, gen ekspresyonunun indüklenebilir inaktivasyonu dokuya özgü veya geçici bir şekilde gerçekleşir.
Koşullu Nakavt nedir?
Koşullu nakavt, ilgilenilen bir genin yalnızca belirli bir doku veya organdan silindiği bir modeldir. Bu model, bir genin zamanında veya dokuya özgü silinmesini içerir. Kurucu nakavt modeli ile karşılaştırıldığında, koşullu nakavt modeli daha ileri düzeydedir. Yalnızca hedef organ veya dokudaki bir geni siler. Örneğin, karaciğeri (organı) etkileyen bir hastalığı incelemek için koşullu nakavt modeli kullanılır. Burada, bilim adamları bu belirli geni karaciğerden ortadan kaldırır. Koşullu nakavt, geleneksel nakavtın yan etkilerini ortadan kaldırır.
Şekil 01: Koşullu Nakavt
Koşullu nakavt, belirli bir gelişim aşamasında nakavt genlerini kolaylaştırır. Ayrıca, bir dokudaki bir genin nakavtının diğer dokularda aynı geni nasıl etkilediğini incelememize de olanak tanır. Bu model genellikle diğer memelilerdeki insan hastalıklarını incelemek için kullanılır. Koşullu nakavt fare modeli, CRISPR gen düzenleme teknolojisi kullanılarak 6 ila 9 ay içinde oluşturulabilir.
Kurucu Nakavt nedir?
Yapıcı Nakavt modeli (geleneksel veya tüm vücut Nakavt), bir hedef genin tüm hayvanda (organizmanın her hücresinde) kalıcı olarak etkisiz hale getirildiği modeldir. Genel olarak, CRISPR gen düzenleme teknolojisini kullanarak bir kurucu nakavt fare modeli oluşturmak dört ila altı ay sürer. Ancak süre, modeli oluşturmak için kullanılan teknolojiye bağlı olarak değişir.
Şekil 02: Nakavt Fare
Koşullu nakavt modeliyle karşılaştırıldığında, kurucu nakavt, yan etkileri olan ilk geliştirilen modeldir. İlgilenilen gen tüm gelişim aşamalarından silinir. Bu nedenle, gen ifadesi hayvanın yaşamı boyunca gerçekleşmez. Temel nakavtla karşılaştırıldığında, koşullu nakavt güvenli, daha kolay ve daha fazla sonuç odaklıdır.
Koşullu ve Yapısal Nakavt Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Koşullu ve yapısal nakavt iki nakavt gen modelidir.
- Her iki modelde de ilgilenilen bir gen elimine edilir.
- Her iki modeli de oluşturan CRISPR gen düzenleme teknolojisi yaygın olarak kullanılmaktadır.
Koşullu ve Yapısal Nakavt Arasındaki Fark Nedir?
Koşullu nakavtta, ilgilenilen gen belirli bir doku tipinde veya belirli bir zaman noktasında etkisiz hale getirilir. Kurucu nakavtta, ilgilenilen gen her zaman için kalıcı olarak etkisiz hale getirilir. Bu, koşullu ve kurucu nakavt arasındaki temel farktır. Koşullu nakavt, kurucu nakavttan daha hedeflidir. Ayrıca, koşullu nakavt güvenlidir ve temel nakavttan daha fazla sonuç odaklıdır.
Aşağıdaki bilgi grafiği, koşullu ve yapısal nakavt arasındaki daha fazla farkı tablo biçiminde listeler.
Özet – Koşullu ve Kurucu Nakavt
Nakavt fareler, in vivo gen fonksiyonunu incelemek için faydalıdır. İnsanlarda bir genin fizyolojik rolü hakkında fikir verirler. Bu nedenle, genetikçilerin genetik hastalıkları tedavi etmek için tedaviler geliştirmeleri için değerli bir araçtır. Koşullu ve kurucu nakavt fareler iki modeldir. Koşullu nakavtta, ilgili bir gen belirli bir doku tipinde veya belirli bir zaman noktasında etkisiz hale getirilir. Yapısal nakavtta, ilgilenilen bir gen her zaman tüm doku tiplerinde kalıcı olarak etkisiz hale getirilir. Bu nedenle, koşullu ve kurucu nakavt arasındaki temel fark budur. Koşullu nakavt, kurucu nakavt ile karşılaştırıldığında daha hedefli, güvenli, daha kolay ve daha fazla sonuç odaklıdır.