dATP ve ddATP arasındaki temel fark, dATP'nin DNA sentezini sonlandırmazken ddATP'nin DNA sentezini sonlandırabilmesidir. Bunun nedeni, ddATP'nin pentoz şekerinin 3ʹ konumuna bağlı bir H atomuna sahip olması, dATP'nin ise 3ʹ konumuna bağlı bir OH grubuna sahip olmasıdır.
dNTP'ler DNA'nın yapı taşlarıdır. Biri pürin veya pirimidin bazları-dATP'ye göre dört tip dNTP vardır. dATP'nin azotlu bazı adenozindir. ddNTP'ler, Sanger dizilemesinde kullanılan nükleotidlerdir. Dört tür ddNTP vardır. ddATP bir ddNTP'dir.
dATP nedir?
Deoksiadenozin trifosfat, DNA'nın yapı taşı olan bir nükleotittir. DNA polimeraz enzimi, DNA sentezi için bir substrat olarak dATP kullanır. dATP'nin üç bileşeni vardır: bir deoksiriboz şeker molekülü, bir adenosin ve üç fosfat grubu. Bu nedenle, bir pürin nükleosit trifosfattır. dATP'nin kimyasal formülü C10H16N5O12 şeklindedir. P3, ve moleküler kütlesi 491.182'dir.
Şekil 01: dATP
dATP, şeker bileşenleri açısından ATP'den (adenosin trifosfat) farklıdır. ATP'de riboz şekeri vardır. Transkripsiyon sırasında urasil nükleotidi ile dATP baz çiftleri. DNA sentezine katılmanın yanı sıra dATP, hücre canlılığını korumak için enerji aktaran bir molekül olarak da işlev görebilir. Vücutta yüksek düzeyde dATP toksiktir, çünkü ribonükleotid redüktaz enzimi için rekabetçi olmayan bir inhibitör görevi görebilir. Bozulmuş bağışıklık fonksiyonuna yol açabilir.
ddATP nedir?
Dideoxyadenosine triphoaphate veya ddATP, Sanger sıralama yönteminde kullanılan dört nükleotid türünden biridir. Yapısal olarak, ddATP ayrıca dATP'ye benzer üç bileşene sahiptir. Bunlar bir adenin bazı, bir deoksiriboz şeker ve üç fosfattır.
Şekil 02: ddATP
dATP'den farklı olarak, ddATP, bitişik nükleotit ile fosfodiester bağı oluşturmak ve zincir uzamasını sürdürmek için pentoz şekerinin 3ʹ konumunda bir OH grubundan yoksundur. 3ʹ konumunda H atomuna sahiptir. Bu nedenle, ddATP bir kez dahil edildiğinde, DNA sentezi sona erer. Sanger dizilemenin temel prensibidir. Bu nedenle, ddATP, Sanger dizilemesinde bir zincir uzaması inhibitörü olarak çalışır. Sanger dizilemesinde kullanılan dört tüp vardır ve bir tüpe ddATP eklenir.
dATP ve ddATP Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- dATP ve ddATP nükleo titlerdir.
- Her ikisi de adenin, deoksiriboz ve üç fosfattan oluşur.
- Organik bileşiklerdir.
- Hem dATP hem de ddATP, Sanger dizilemesinde tüplere eklenir.
dATP ve ddATP Arasındaki Fark Nedir?
dATP, pentoz şekerinin 3ʹ konumunda bir OH grubuna sahipken, ddATP, pentoz şekerinin 3ʹ konumunda bir OH grubundan yoksundur. Ayrıca, dATP, DNA sentezinde kullanılan bir monomerdir, ddATP ise Sanger dizilimi sırasında zincir uzamasını sonlandırmak için kullanılır. Bu, dATP ve ddATP arasındaki temel farktır. Ayrıca, dATP fosfodiester bağları oluşturabilirken ddATP fosfodiester bağları oluşturamaz.
Aşağıdaki bilgi grafiği, yan yana karşılaştırma için tablo biçiminde dATP ve ddATP arasındaki daha fazla farkı gösterir.
Özet – dATP vs ddATP
Kısacası, dATP DNA sentezinin öncüsüdür, ddATP ise Sanger dizilemesinde DNA sentezini sonlandırmak için kullanılan bir nükleotittir. Ayrıca dATP, pentoz şekerin 3ʹ konumunda bir OH grubuna sahiptir ve bir sonraki nükleotit ile bir fosfodiester bağının oluşmasını sağlar. Bu arada, ddATP 3ʹ konumunda OH grubundan yoksundur; bu nedenle, bir sonraki nükleotit ile bir fosfodiester bağı oluşturamaz. Sonuç olarak, DNA dizisi uzamasını durdurur. Böylece, bu dATP ve ddATP arasındaki farkı özetler.
