Fikosiyanin ve allofikosiyanin arasındaki temel fark, fikosiyanin, allofikosiyanin'den daha kısa dalga boylarında emer ve yayar.
Fikobiliproteinler, siyanobakterilerde ve belirli alg türlerinde bulunan suda çözünür protein ailesidir. Phycocyanin ve allophycocyanin bu ailenin iki önemli üyesidir.
Fikosiyanin nedir?
Phycocyanin, hafif hasat eden fikobiliprotein ailesinden bir pigment-protein kompleksidir. Bu ailenin diğer önemli üyeleri arasında allofikosiyanin ve fikoeritrin bulunur. Bu pigment, klorofil için bir yardımcı pigmenttir. Genel olarak, tüm fikobiliproteinler, karotenoidler gibi zarlarda bulunamayan suda çözünür komplekslerdir. Zarlarda var olmak yerine, bu pigmentler bir araya gelerek fikobilizom olarak bilinen zarlara yapışabilen kümeler oluşturma eğilimindedir.
Şekil 01: Ekstrakte Phycocyanin Pigmentleri (Siyanobakterilerden)
Phycocyanin'in turuncu ve kırmızı ışığı emebilen (620 nm civarında) ve floresan yayabilen (650 nm civarında) karakteristik bir açık mavi renge sahip olduğunu gözlemleyebiliriz. Bu renk pigmentini siyanobakterilerde bulabiliriz ve "Phycocyanin" adı Yunanca "alg" anlamına gelen "Phyco" anlamına gelir ve Yunanca "koyu mavi" anlamına gelen "Kyanos" anlamına gelen "siyanin" son ekinden gelir.
Tipik olarak, Phycocyanin molekülleri tüm fikobiliproteinlerle ortak bir yapıyı paylaşır. Bu pigmentin yapısı düşünüldüğünde, fikobiliprotein monomerlerinin birleşmesi ile başlar. Bu monomerler, ilgili kromoforları ile alfa ve beta alt birimlerinden oluşan heterodimerlerdir. Kromoforlar ve alt birimler, bir tiyoeter kimyasal bağ aracılığıyla birleştirilir.
Phycocyanin yapısının alt birimleri tipik olarak sekiz alfa sarmal içerir. Monomer yapıları, dönme simetrisine ve merkezi bir kanala sahip halka şeklinde trimerler oluşturarak kendiliğinden toplanma eğilimindedir. Ayrıca trimerler, ek bağlayıcı proteinlerle desteklenen heksamerler oluşturarak çiftler halinde toplanma eğilimindedir. Bu nedenle, her fikobilizom çubuğu iki veya daha fazla Phycocyanin heksameri içerir.
Alofikosiyanin nedir?
Allophikosiyanin, fikobiliprotein ailesinden gelen bir protein molekülüdür ve klorofil için bir aksesuar pigmenttir. Bu hafif hasat eden phycobiliprotein ailesinin diğer üyeleri arasında Phycocyanin, phycoerythrin ve phycoerythrocyanin bulunur. Allofikosiyanin pigmentleri kırmızı ışığı emebilir ve yayabilir ve bu pigmenti siyanobakterilerde ve kırmızı alglerde kolayca bulabiliriz.
Şekil 02: Bir Diyagramda Allofikosiyanin Görünümü
Alofikosiyanini çeşitli kırmızı veya mavi-yeşil alg türlerinden izole edebiliriz. Bu algler, molekülün biraz farklı formlarını üretir. Genel olarak allofikosiyanin molekülü, alfa ve beta alt birimi olarak adlandırılan iki farklı alt birim içerir. Her alt birimin bir fikosiyanobilin kromoforu vardır.
Alofikosiyanin'in farklı uygulamaları vardır; allofikosiyanin için özel olarak birçok araç geliştirilmiştir. Örneğin, bu bileşen FACS, akış sitometrisi vb. dahil olmak üzere immünolojik testlerde yaygın olarak kullanılır.
Phycocyanin ve Allophycocyanin Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Fikosiyanin ve allofikosiyanin suda çözünür proteinlerdir
- Her ikisi de fikobiliprotein ailesine dahildir.
Phycocyanin ve Allophycocyanin Arasındaki Fark Nedir?
Fikobiliproteinler, siyanobakterilerde ve belirli alg türlerinde bulunan suda çözünür protein ailesidir. Phycocyanin ve allophycocyanin bu ailenin iki ana üyesidir. Phycocyanin ve allophycocyanin arasındaki temel fark, Phycocyanin'in allofikosiyanin'den daha kısa dalga boylarında emmesi ve yaymasıdır.
Aşağıdaki infografik, yan yana karşılaştırma için phycocyanin ve allophycocyanin arasındaki daha fazla farkı tablo şeklinde listeler.
Özet – Phycocyanin vs Allophycocyanin
Fikobiliproteinler, siyanobakterilerde ve belirli alg türlerinde bulunan suda çözünür protein ailesidir. Phycocyanin ve allophycocyanin bu ailenin iki ana üyesidir. Phycocyanin ve allophycocyanin arasındaki temel fark, Phycocyanin'in allophycocyanin'den daha kısa dalga boylarında emmesi ve yaymasıdır.
