Avidin ve streptavidin arasındaki temel fark, avidinin biotine yüksek bir afiniteye ve özgüllüğe sahip olması, ancak streptavidin-biotin kovalent olmayan bir bağa sahip en güçlü komplekslerden biri olması nedeniyle streptavidin'den nispeten daha az afiniteye sahip olmasıdır.
Avidin, kuşların, sürüngenlerin ve amfibilerin yumurta kanallarında oluşan bir protein türüdür. Streptavidin, Streptomyces avidinii bakterisinin saflaştırılmasından hazırlanan bir protein türüdür.
Avidin nedir?
Avidin, kuşların, sürüngenlerin ve amfibilerin yumurta kanallarında oluşan bir protein türüdür. Bu protein, yumurta beyazlarında biriken tetramerik bir biyotin bağlayıcı proteindir. Avidinin tetramerik formlara ek olarak dimerik üyeleri vardır. Bu dimerik formları bazı bakterilerde bulabiliriz. Tavuk yumurtası beyazı düşünüldüğünde, toplam protein içeriğine göre yaklaşık %0.05 avidin içerir.
Şekil 01: Avidin Molekülünün Kimyasal Yapısı ve Görünümü
Tetramerik proteinde dört özdeş alt birim vardır. Bu nedenle, ona bir homotetramer diyebiliriz. Her tetramer biotin (B7 vitamini olarak da adlandırılır) ile bağlanabilir. Bu bağlanmanın afinitesi ve özgüllüğü çok yüksektir. Avidin-biotin kompleksi, bilinen en güçlü kovalent olmayan bağlardan biridir.
İşlevsel avidini çiğ yumurtalarda bulabiliriz. Pişirildiğinde, avidin için biyotin afinitesi yok olur. Ancak avidin yumurtasının doğal işlevi henüz tam olarak bilinmemektedir. Bilim adamları, bu proteinin yumurtanın yumurta kanalında bakteri üreme inhibitörü olarak oluştuğunu öne sürdüler. Biyotin ile bağlanabilir (biyotin bakteri üremesine yardımcı olur).
Ayrıca, ticari bir ürün olarak temin edilebilen glikosile edilmemiş bir avidin formu vardır. Bu glikosile edilmemiş formun doğal olarak oluşup oluşmadığı hala bilinmemektedir. Bu proteinin araştırma uygulamaları, biyokimyasal testler, saflaştırma ortamı vb. dahil bazı önemli uygulamaları vardır.
Streptavidin nedir?
Streptavidin, Streptomyces avidinii bakterisinin saflaştırılmasından hazırlanan bir protein türüdür. Bir tetramerdir. Biyotin için olağanüstü yüksek bir afiniteye sahip olan streptavidin homo-tetramerleri vardır. Biotinin streptavidine bağlanmasının doğadaki en güçlü kovalent olmayan etkileşimlerden biri olduğu bilinmektedir. Bu protein, streptavidin-biyotin kompleksinin organik çözücülere, denaturantlara, proteolitik enzimlere, aşırı sıcaklıklara, pH değerlerine ve deterjanlara karşı direnci nedeniyle moleküler biyoloji ve biyo-nanoteknolojide faydalıdır.
Şekil 02: Streptavidin Molekülünün Yapısı ve Görünümü
Streptavidinin çeşitli biyomoleküllerin saflaştırılması veya tespiti, saflaştırılması ve genetiği değiştirilmiş pep titlerin tespiti, Western blot, Nanobiyoteknoloji geliştirme vb. gibi önemli uygulamaları vardır.
Avidin ve Streptavidin Arasındaki Fark Nedir?
Avidin, kuşların, sürüngenlerin ve amfibilerin yumurta kanallarında oluşan bir protein türüdür. Streptavidin, Streptomyces avidinii bakterisinin saflaştırılmasından hazırlanan bir protein türüdür. avidin ve streptavidin arasındaki temel fark, avidinin biyotin için yüksek bir afiniteye ve özgüllüğe sahip olması, ancak streptavidin-biotin kovalent olmayan bir bağa sahip en güçlü komplekslerden biri olduğu için streptavidin'den nispeten daha az afiniteye sahip olmasıdır.
Aşağıdaki infografik, yan yana karşılaştırma için avidin ve streptavidin arasındaki farkları tablo biçiminde sunar.
Özet – Avidin ve Streptavidin
Avidin ve streptavidin önemli proteinlerdir. avidin ve streptavidin arasındaki temel fark, avidinin biyotin için yüksek bir afiniteye ve özgüllüğe sahip olması, ancak streptavidin-biotin kovalent olmayan bir bağa sahip en güçlü komplekslerden biri olması nedeniyle streptavidin'den nispeten daha az afiniteye sahip olmasıdır.
