DNA transpozonları ve retrotranspozonlar arasındaki temel fark, DNA transpozonlarının bir kes ve yapıştır mekanizması kullanarak genomda bir yerden başka bir yere hareket eden mobil genetik elementlerken, retrotranspozonlar bir yerden hareket eden mobil genetik elementlerdir. kopyala ve yapıştır mekanizmasını kullanarak genomdaki bir başkasına.
Mobil genetik elementler (MGE'ler), genom içindeki hareketlerine aracılık eden veya bir türden diğerine aktarılabilen spesifik enzimleri ve proteinleri kodlayan DNA segmentleridir. Bencil genetik unsurlar olarak da bilinirler. Transposable elementler, çeşitli mobil genetik element tiplerinden birini temsil eder. İki ana tip transpozon elementi vardır: DNA transpozonları ve retrotranspozonlar. Bu nedenle DNA transpozonları ve retrotranspozonlar, genomda bir yerden bir yere hareket edebilen mobil genetik elementlerdir.
DNA Transpozonları nelerdir?
DNA transpozonları, kes ve yapıştır mekanizması kullanarak genomda bir yerden başka bir yere hareket eden hareketli genetik elementlerdir. Bir DNA ara maddesi boyunca hareket eden sınıf II yer değiştirebilir elementlere aittirler. Bu, bir RNA ara maddesi boyunca hareket eden sınıf I yer değiştirebilir elemanlara (retrotranspozonlar) karşıdır. Normalde DNA transpozonları, kes ve yapıştır yöntemi kullanılarak genom içinde hareket eder. Bu yöntem, DNA'nın genomdaki mevcut konumundan hareketini ve yeni konuma yerleştirilmesini katalize eden bir transpozaz enzimi gerektirir.
Şekil 01: DNA Transpozonları
Bu transpozisyon, transpozonda üç DNA bölgesi gerektirir (transpozonun her iki ucunda ikişer terminal ters tekrarlar ve birer hedef bölgede). Transpozaz enzimi, transpozonun terminal ters çevrilmiş tekrarlarına bağlanacak ve transpozon uçlarının sinapslarına aracılık edecektir. Daha sonra transpozaz enzimi, elementi orijinal donör bölgesinin komşu DNA'sından ayırır ve transpozonun genomdaki yeni yerleştirme bölgesine bağlanmasına aracılık eder. Yeni konuma transpozon eklenmesi, eklenen segmentin her iki tarafında kısa boşluklara neden olur. Konak sistemler bu boşlukları onararak, transpozisyonun özelliği olan hedef dizi çoğ altması (TSD) ile sonuçlanır.
Retrotranspozonlar nelerdir?
Retrotranspozonlar, kopyala ve yapıştır mekanizması kullanarak genomda bir yerden başka bir yere hareket eden hareketli genetik elementlerdir. Sınıf I yer değiştirebilir elemanlara aittirler. Sınıf I yer değiştirebilir elementler (retrotranspozonlar), genomdaki bir RNA ara maddesi boyunca hareket eder. Kendilerini farklı genomik konumlara kopyalayıp yapıştıran bir tür genetik bileşendir.
Şekil 02: Retrotranspozonlar
İlk olarak, DNA'dan RNA'ya kopyalanırlar. Daha sonra üretilen RNA, DNA'ya ters kopyalanır. Bu kopyalanan DNA daha sonra yeni bir konumda genoma geri eklenir. Ters transkripsiyon, ters transkriptaz tarafından katalize edilir. Ters transkriptaz genellikle retrotranspozon tarafından kodlanır. Entegrasyon, integraz adı verilen bir enzim tarafından gerçekleştirilir. Ayrıca, genellikle üç tiptir: uzun terminal tekrarları (LTR), uzun serpiştirilmiş nükleer elementler (LINE) ve kısa serpiştirilmiş nükleer elementler (SINE).
DNA Transpozonları ve Retrotranspozonlar Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- DNA transpozonları ve retrotranspozonlar mobil genetik elementlerdir.
- Her ikisi de yer değiştirebilen öğeler altında sınıflandırılır.
- Her ikisi de zıplayan genler olarak bilinir.
- Genomda bir yerden bir yere hareket edebilirler.
- Evrimsel olarak çok önemlidirler.
DNA Transpozonları ve Retrotranspozonlar Arasındaki Fark Nedir?
DNA transpozonları, kes ve yapıştır mekanizması kullanarak genomda bir yerden başka bir yere hareket eden mobil genetik elementlerdir, retrotranspozonlar ise kopya ve yapıştırma mekanizması Dolayısıyla, bu DNA transpozonları ve retrotranspozonlar arasındaki temel farktır. Ayrıca, DNA transpozonları sınıf II yer değiştirebilir elementlere, retrotranspozonlar ise sınıf I yer değiştirebilir elementlere aittir.
Aşağıdaki infografik, DNA transpozonları ve retrotranspozonlar arasındaki farkları yan yana karşılaştırma için tablo şeklinde sunar.
Özet – DNA Transpozonları ve Retrotranspozonlar
DNA transpozonları ve retrotranspozonlar mobil genetik elementlerdir. DNA transpozonları, kes yapıştır mekanizması kullanarak genomda bir yerden başka bir yere hareket eder. Retrotranspozonlar, bir kopyala ve yapıştır mekanizması kullanarak genomda bir yerden diğerine hareket eder. Bu, DNA transpozonları ve retrotranspozonlar arasındaki farkı özetler.
