Anahtar Fark – Retrovirüs ve Bakteriyofaj
Virüsler, yalnızca canlı bir organizmanın içinde çoğalan küçük bulaşıcı parçacıklardır. Hayvanlar, bitkiler ve bakteriler dahil hemen hemen tüm canlı organizmaları enfekte edebilirler. Protein kapsidleri ve DNA veya RNA genomundan oluşan mikroskobik parçacıklardır. Virüsün genomu, DNA veya RNA, tek sarmallı veya çift sarmallı, dairesel veya doğrusal olabilir. B altimore sınıflandırma sistemine göre virüsler, sahip oldukları genom tipine göre yedi gruba ayrılabilir. Retrovirüs ve bakteriyofaj, virüsün iki önemli kategorisidir.temel fark retrovirüs ve bakteriyofaj arasında retrovirüs, pozitif anlamda tek sarmallı RNA genomu içeren ve bir DNA ara maddesi yoluyla çoğalabilen bir virüs grubudur, bakteriyofaj ise DNA veya RNA genomu içeren bakteri bulaşan bir virüstür..
Retrovirüs nedir?
Retrovirüs, pozitif anlamda tek sarmallı RNA genomuna sahip viral bir gruptur. Ters transkriptaz adı verilen bir enzim içerirler ve replikasyonları bir DNA ara maddesi yoluyla gerçekleşir. Replikasyon sırasında bir ara DNA üretimi bu virüs grubuna özgüdür.
Enfeksiyon sırasında retrovirüsler, viral partikülün dış yüzeyinde bulunan spesifik glikoproteinler aracılığıyla konakçı hücreye bağlanır. Hücre zarı ile birleşerek konak hücreye girerler. Konakçı hücre sitoplazmasına nüfuz ettikten sonra, retrovirüs ters transkriptaz enzimi kullanarak genomunu çift sarmallı DNA'ya kopyalar. Yeni DNA, integraz adı verilen bir enzim kullanarak konak hücre genomuna dahil olur. Enfeksiyon meydana gelse de, konakçı hücre entegrasyondan sonra viral DNA'yı tanıyamaz. Bu nedenle, konakçı genom replikasyonu sırasında viral genom, viral partiküllerin yeni kopyalarını yapmak için gerekli proteinleri çoğ altır ve üretir.
İnsan immün yetmezlik virüsü (HIV) ve insan T-hücresi lösemi virüsü (HTLV), yaygın insan retrovirüsleridir. HIV hastalık AID'lerine neden olur ve HTLV lösemiye neden olur.
Viral genomu konakçı organizmaların içine yerleştirme konusundaki doğal yetenekleri nedeniyle, retrovirüsler gen dağıtım sistemlerinde kullanılır ve Moleküler Biyolojide değerli araştırma araçları olarak kabul edilirler.
Şekil 01: HIV replikasyonu
Bakteriyofaj nedir?
Bir bakteriyofaj (faj), belirli bir bakteriyi enfekte eden ve içinde yayılan bir virüstür. Bakterisidal ajanlar olarak hareket ettikleri için bakteri yiyiciler olarak da bilinirler. Bakteriyofajlar, 1915 yılında Frederick W. Twort tarafından keşfedilmiş ve 1917 yılında Felix d'Herelle tarafından bakteriyofaj olarak adlandırılmıştır. Yeryüzünde en çok bulunan virüslerdir. Ayrıca bir genom ve bir protein kapsitinden oluşurlar. Bakteriyofaj genomu, DNA veya RNA olabilir. Ancak bakteriyofajların büyük çoğunluğu çift sarmallı DNA virüsleridir.
Bakteriyofajlar bir bakteriye veya belirli bir bakteri grubuna özgüdür. Bakteri suşu veya enfekte ettikleri türlerle adlandırılırlar. Örnek olarak E. coli'yi enfekte eden bakteriyofajlara kolifaj denir. Bakteriyofajlarda farklı şekiller vardır. Bakteriyofajların sahip olduğu en yaygın şekil baş ve kuyruk şeklidir.
Bakteriyofajlar çoğalmak için konak hücreyi enfekte etmelidir. Yüzey reseptörlerini kullanarak bakteri hücre duvarına sıkıca tutunurlar ve genetik materyallerini konakçı hücreye enjekte ederler. Bakteriyofajlar, litik ve lizojenik döngü adı verilen iki tür enfeksiyona maruz kalabilirler. Faj tipine bağlıdır. Litik döngüde, bakteriyofajlar bakterileri enfekte eder ve konakçı bakteri hücresini lizis yoluyla hızla öldürür. Lizojenik döngüde, viral genetik materyal, bakteri genomu veya plazmitlerle bütünleşir ve konakçı hücrede konakçı bakteriyi öldürmeden birkaç ila bin nesil boyunca bulunur.
Fajların moleküler biyolojide çeşitli uygulamaları vardır. Antibiyotiklere dirençli patojenik bakteri suşlarını tedavi etmek için kullanılırlar. Ayrıca hastalık teşhisinde belirli bakterileri tanımlamak için de kullanılabilirler.
Şekil 02: Bakteriyofaj enfeksiyonu
Retrovirüs ve Bakteriyofaj arasındaki fark nedir?
Retrovirüs ve Bakteriyofaj |
|
| Retrovirüs, tek sarmallı bir RNA genomu içeren bir virüs grubudur. | Bakteriyofaj, bakterileri enfekte eden ve bakterilerin içinde çoğalan bir virüstür. |
| Ters Transkriptaz Varlığı | |
| Retrovirüs, ters transkriptaz adı verilen enzimi içerir. | Bakteriyofaj ters transkriptaz içermez. |
| Ters Transkripsiyonun Oluşması | |
| Ters transkripsiyon viral replikasyon sırasında gerçekleşir | Ters transkripsiyon, viral replikasyon sırasında gerçekleşmez. |
| DNA Intermediate Üretimi | |
| Retrovirüsler genomun ara DNA kopyasını üretir. | Bakteriyofaj DNA ara maddesi üretmez. |
Özet – Retrovirüs ve Bakteriyofaj
Retrovirüs ve bakteriyofaj iki tür virüstür. Retrovirüs, bir ara DNA aracılığıyla çoğalan, pozitif anlamda tek sarmallı RNA genomuna sahip bir virüs grubudur. Bakteriyofaj, bakterilere saldıran ve bakteriyel replikasyon mekanizmalarını kullanarak çoğalan bir virüstür. Bakteriyofajlar biyosferde en bol bulunan virüslerdir ve DNA veya RNA genomlarına sahip olabilirler. Retrovirüs ve bakteriyofaj arasındaki fark budur.
