Synteny ve collinearity arasındaki temel fark, synteny, türlerde aynı kromozom üzerindeki genetik lokusların fiziksel olarak birlikte lokalizasyonu iken, collinearity, farklı türlerde aynı kromozom üzerindeki genetik lokusların fiziksel olarak birlikte lokalizasyonudur. aynı sıra.
Synteny ve eşdoğrusallık, genomikte birbirinin yerine kullanılan iki terimdir. Her iki terim de farklı türlerdeki kromozomlar üzerindeki gen lokalizasyon modellerini tanımlar. Taksonlar arasındaki bu ilgili gen düzenlemeleri, genlerin ortak atalarını çıkarırken değerli bilgilerdir. Synteny, türlerde aynı kromozom üzerindeki genetik lokusların fiziksel olarak birlikte lokalizasyonunu ifade eder. Aynı sırayı koruyan farklı türlerde aynı kromozom üzerindeki genetik lokusların fiziksel olarak birlikte lokalizasyonu anlamına gelir. Bu nedenle, bir sentez biçimidir.
Synteny nedir?
Farklı türlerde, aynı kromozom üzerinde bulunan bir dizi gen vardır. Ve farklı türlerde aynı kromozom üzerindeki genlerin bu fiziksel birlikte lokalizasyonu, synteny olarak bilinir. Ayrıca bu genler tek bir kromozom üzerinde birbirine çok yakın bulunur. Genlerin sırası mutlaka aynı olmayabilir. Ancak aynı kromozom üzerinde birbirine yakın genlerin lokalizasyonu synteny'de gerçekleşir. Bu nedenle, synteny esas olarak bir kromozom üzerindeki genlerin dağılım modelini tanımlar. Bu gen ortak lokalizasyon kalıpları, farklı türler ve onların evrimi arasındaki ilişkileri gösterir. Ancak, translokasyonlar, inversiyon ve kromozom füzyonu vb. duplikasyonlar, kayıp ve eşit olmayan homolog rekombinasyon gibi kromozomal yeniden düzenlemeler nedeniyle sentez bozulabilir.
Şekil 01: Synteny
Bütün bağlantılı genlerin sentetik olduğuna inanılır. Bununla birlikte, tüm sentenik genler mutlaka bağlantılı değildir. Ortak kromozom dizilerine sahiptirler. İnsanlarda diğer memelilerle birlikte birçok sentetik gen bulunur. Ayrıca, birçok tahılın sentetik genleri vardır.
Kolinearlık nedir?
Collinearity, bir dizi genin farklı türlerin aynı kromozomu üzerinde atasal türlerde olduğu gibi aynı sırada yer aldığı daha spesifik bir sentez biçimidir. Bu nedenle, eğer eşdoğrusallıktan bir sapma varsa, eşdoğrusallık genlerin ortak atalarını açıkladığı için daha güvenilir bir filogenetik karakter olacaktır.
Şekil 02: Doğrusallık
Çok yönlü doğrusallık analizi, ilgili türler ve filogenileri hakkında çok daha güvenilir bilgiler sağlar.
Synteny ve Collinearity Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Hem synteny hem de collinearity'de, aynı kromozom üzerinde iki farklı türdeki bir lokus kümesi bulunur.
- Bu terimler, aynı kromozom üzerindeki genetik lokusların fiziksel olarak birlikte lokalizasyonunu tanımlar.
- Collinearity, synteny'nin daha spesifik bir şeklidir.
- Bazen genomikte her iki terim de birbirinin yerine kullanılır.
- İki bölgenin eşdoğrusallığı varsa, bunlar açıkça sinteniktir.
- Soyogeni hakkında çıkarımlarda bulunurlar.
Synteny ve Collinearity Arasındaki Fark Nedir?
Synteny ve eşdoğrusallık, genomikte birbirinin yerine kullanılan iki terimdir. Synteny, farklı türlerde aynı kromozomdaki bir dizi genin fiziksel olarak birlikte lokalizasyonunu ifade eder. Collinearity, gen setinin farklı türler arasında aynı sırada birlikte lokalize olduğu bir sentez biçimidir. Bu nedenle, synteny ve collinearity arasındaki temel fark budur.
Özet – Synteny ve Collinearity
Synteny ve collinearity terimleri, farklı türlerde aynı kromozom üzerinde bulunan bir dizi gen anlamına gelir. Aslında, bu genler farklı türlerde aynı kromozomda ortak lokalizedir. Synteny, farklı türlerde aynı kromozom üzerindeki set genlerin fiziksel olarak birlikte lokalizasyonunu tanımlarken, collinearity, gen setinin aynı sırada birlikte lokalize edildiği daha spesifik bir synteny şeklidir. Böylece, synteny ve collinearity arasındaki farkı özetler.
