Restriksiyon endonükleazı ve eksonükleaz arasındaki temel fark, restriksiyon endonükleazının belirli bir DNA dizisini tanıyan ve bu dizi içindeki veya bitişiğindeki DNA'yı parçalayan bir nükleaz enzimi olması, eksonükleazın ise bir 5' ucundan veya 3' ucundan birer birer polinükleotit.
Nükleazlar, nükleik asitlerin nükleo titleri arasındaki fosfodiester bağlarını parçalayan enzimlerdir. Canlı organizmalarda, hücrede DNA onarımının birçok yönü için gerekli araçlardır. Bu enzimlerin kusurları, genetik kararsızlığa ve immün yetmezliğe neden olabilir. Kısıtlama nükleazları, işlevleri belirli bir nükleotid dizisine bağlı olan spesifik nükleazlardır. Bir örnek, kısıtlama endonükleazıdır. Endonükleaz ve eksonükleaz gibi aktivite odağına dayalı olarak nükleazlar için temel bir sınıflandırma vardır. Endonükleaz, hedef DNA molekülünün ortasındaki bölgeleri sindirir. Eksonükleaz, nükleik asitleri uçlarından sindirir. Bu nedenle, kısıtlama endonükleaz ve eksonükleaz, iki tür nükleaz enzimidir.
Kısıtlama Endonükleaz nedir?
Kısıtlama endonükleazı, belirli bir DNA dizisini tanıyan ve DNA'yı bu dizinin içinde veya bitişiğinde parçalayan bir nükleaz enzimidir. Spesifik DNA dizisi, kısıtlama bölgesi olarak bilinir. Aynı zamanda bir kısıtlama enzimi veya kısıtlama enzimi olarak da adlandırılır. Restriksiyon endonükleaz çok spesifik bir enzimdir. Daha geniş endonükleaz enzim grubunun bir sınıfıdır. Kısıtlama endonükleazları, yapıları ve tanıma bölgesinde DNA substratını kesme yetenekleri bakımından farklılık gösteren genel olarak beş tipte sınıflandırılır. Beş tip tip I, tip II, tip III, tip IV ve tip V'dir.
Şekil 01: Restriksiyon Endonükleaz
Kısıtlama endonükleazları genellikle bakteri ve arkelerde bulunur. Bakteriler için virüslere karşı bir savunma mekanizması sağlarlar. 3600'den fazla bilinen kısıtlama endonükleazı vardır. 250'den fazla farklı özelliği temsil ederler. Bunların 3000'den fazlası ayrıntılı olarak incelenmiştir. Ayrıca bunlardan 800'den fazlası ticari olarak mevcuttur.
Eksonükleaz nedir?
Eksonükleaz, bir polinükleotitteki nükleo titleri her seferinde 5' uçtan veya 3' uçtan birer birer parçalayan bir nükleaz enzimidir. Bu, sonunda nükleo titler arasındaki fosfodiester bağlarını kıran bir hidrolize edici reaksiyon yoluyla gerçekleşir. Ökaryotlar ve prokaryotlar üç tip eksonükleaz içerir. Bu eksonükleazlar, mRNA'nın normal döngüsünde yer alır. Bunlar 5' ila 3' eksonükleaz (Xrn1), 3' ila 5' eksonükleaz ve poli-A'ya özgü 3' ila 5' eksonükleazdır. 5' ila 3' eksonükleaz, bağımlı bir kapak açma proteinidir. 3' ila 5' eksonükleaz bağımsız bir proteindir. Poli A'ya özgü 3' ila 5' ekzonükleaz, poli-A kuyruğunun ekzonükleolitik bozunmasında yer alan poli-A'ya özgü ribonükleaz olarak da bilinir.
Şekil 02: Eksonükleaz
Hem arke hem de ökaryotlarda RNA bozunması, 3' ila 5' eksoribonükleazlardan oluşan çoklu protein eksozom kompleksi tarafından gerçekleştirilir.
Kısıtlama Endonükleaz ve Eksonükleaz Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Kısıtlama endonükleazı ve eksonükleaz, iki tür nükleaz enzimidir.
- Her iki enzim de DNA moleküllerini keser.
- Bu enzimler prokaryotlarda bulunur.
- Onlar proteindir.
Kısıtlama Endonükleaz ve Eksonükleaz Arasındaki Fark Nedir?
Kısıtlama endonükleazı, belirli bir DNA dizisini tanıyan ve DNA'yı bu dizinin içinde veya bitişiğinde parçalayan bir nükleaz enzimidir; ekzonükleaz ise bir polinükleotitteki nükleo titleri 5' ucundan veya 3' ucundan ayıran bir nükleaz enzimidir. birer birer. Bu, kısıtlama endonükleaz ve eksonükleaz arasındaki temel farktır. Ayrıca, kısıtlama endonükleazı yalnızca prokaryotlarda bulunurken, eksonükleaz hem prokaryotlarda hem de ökaryotlarda bulunur.
Aşağıdaki bilgi grafiği, yan yana karşılaştırma için kısıtlama endonükleaz ve eksonükleaz arasındaki farkları tablo biçiminde listeler.
Özet – Restriksiyon Endonükleaz ve Eksonükleaz
Nükleazlar, nükleik asitlerin nükleo titleri arasındaki fosfodiester bağlarını kıran enzimlerdir. Kısıtlama endonükleaz ve eksonükleaz, iki tip nükleaz enzimidir. Kısıtlama endonükleaz, belirli bir DNA dizisini tanıyan ve DNA'yı bu dizi içinde veya bitişiğinde parçalayan bir nükleaz enzimidir. Eksonükleaz, bir polinükleotitteki nükleo titleri 5' uçlarından veya 3' uçlarından birer birer ayıran bir nükleaz enzimidir. Dolayısıyla bu, restriksiyon endonükleaz ve eksonükleaz arasındaki farkı özetler.
