Bir maya hibriti ve maya iki hibrit arasındaki temel fark, maya bir hibrit, DNA-protein etkileşimlerini analiz etmek için in vitro tabanlı bir test iken, maya iki hibrit, protein-protein etkileşimlerini analiz etmek için in vitro tabanlı bir tahlildir.
Hücresel moleküller arasındaki etkileşimleri incelemek, gen ekspresyonu ve protein yollarında yer alan tanıma bölgelerinin tanımlanmasına yardımcı olabilir. DNA ve protein etkileşimleri, DNA modifikasyonları ve transkripsiyonel düzenleme vb. gibi hücresel süreçlerin ayrılmaz bir parçasıdır. Öte yandan, protein ve protein etkileşimleri, replikasyon, transkripsiyon, translasyon ve sinyal iletimi gibi hücresel işlemlerde hayati roller oynar. Bu nedenle, hücresel moleküllerin bu etkileşimlerini farklı deneylerle tanımlamak kritik derecede önemlidir. Maya bir hibrit ve maya iki hibrit, DNA-protein ve protein-protein etkileşimlerini analiz etmek için iki in vitro tabanlı tahlildir.
Yeast One Hybrid nedir?
Yeast one hybrid (Y1H), hücre içi DNA-protein etkileşimlerini analiz etmek için in vitro tabanlı bir testtir. Bu yöntem ilk olarak 1993 yılında Wang ve Reed tarafından kurulmuştur. O zamandan beri biyolojik araştırmalarda daha büyük bir güç göstermiştir. Bu tahlilde iki ana bileşen vardır: DNA yemi ve protein avları.
Şekil 01: Yeast One Hybrid
Prosedürde, bir DNA dizisi (DNA yemi) önce iki farklı habercinin (HIS3, LacZ) yukarı akışında klonlanır. Bu haberci yapılar, bir maya türünün genomuna entegre edilmiştir. Transkripsiyonel faktörler protein avı olarak alınır. Transkripsiyonel faktörler, hibrit proteinler yapmak için maya Gal4 transkripsiyonel faktörünün transkripsiyonel aktivasyon alanına (AD) kaynaştırılır. Bu hibrit proteinin tamamı, maya suşuna dahil edilmeden önce bir plazmide entegre edilir. Rekombinant plazmitin eklenmesinden sonra, transkripsiyonel faktör DNA fragmanı ile etkileşime girdiğinde, AD kısmı raportör gen ekspresyonunu (HIS3 veya LacZ) aktive eder. Plazmitlerin sıralanması, DNA parçasına bağlanabilen transkripsiyonel faktörün tanımlanmasına izin verir. Son zamanlarda, hastalık teşhisini araştırmak için maya bir hibrit yöntemi kullanıldı. Bu nedenle, gelecekte bu test, bilimsel araştırmalarda ve tıbbi tedavilerde daha yaygın olarak kullanılacaktır.
Yeast Two Hybrid nedir?
Yeast Two hybrid (Y2H), hücre içi protein ve protein etkileşimlerini analiz etmek için in vitro tabanlı bir testtir. Bu yöntem ilk olarak 1989 yılında Stanley Fields ve Ok-Kyu Song tarafından bulunmuştur. Bu teknik, mayanın Gal4 transkripsiyon faktörünü kullanarak protein-protein etkileşimlerini tespit eder.
Şekil 02: Maya İki Hibrit
Bu yöntemde, ilk önce ilgili proteinler kullanılarak iki füzyon (hibrit) oluşturulur: bir proteini DNA bağlama alanı (DBD) ile birleştirmek ve diğer proteini Gal4 transkripsiyon faktörünün aktivatör alanı (AD) ile birleştirmek. DBD ile kaynaşmış protein yem olarak bilinirken, AD ile kaynaşmış protein av olarak bilinir. Maya suşunda, yem ve avın etkileşimi üzerine, DBD ve AD, raportör genin yukarısında bir fonksiyonel Gal4 transkripsiyon faktörü oluşturmak için yakınlaştırılır. Fonksiyonel transkripsiyon faktörü, raportör gen ekspresyonunu aktive eder. Ayrıca, bu yöntem şu anda memeli hücrelerinde integral membran proteinlerinin etkileşimlerini taramak için kullanılmaktadır.
Yeast One Hybrid ve Yeast Two Hybrid Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Maya bir hibrit ve maya iki hibrit, DNA-protein ve protein-protein etkileşimlerini analiz etmek için iki in vitro tabanlı testtir.
- Bu testler maya suşlarını kullanır.
- Her iki test de Gal4 transkripsiyon faktörünün aktivasyon alanını (AD) kullanır.
- Etkileşimleri tespit etmek için raportör gen (HIS3 veya LacZ) ifadesini kullanırlar.
- Yemleri ve avları var.
- Her iki test de modern biyolojik araştırmalarda oldukça faydalıdır.
Yeast One Hybrid ve Yeast Two Hybrid Arasındaki Fark Nedir?
Maya bir hibrit, DNA ve protein etkileşimlerini analiz etmek için in vitro tabanlı bir tahlilken, maya iki hibrit, protein ve protein etkileşimlerini analiz etmek için in vitro tabanlı bir tahlildir. Bu nedenle, maya bir hibrit ve maya iki hibrit arasındaki temel fark budur. Ayrıca, bir hibrit mayada yem bir DNA parçasıdır ve av bir protein molekülüdür. Öte yandan, maya iki melezinde hem yem hem de av protein molekülleridir.
Aşağıdaki infografik, yan yana karşılaştırma için maya bir hibrit ve maya iki hibrit arasındaki farkları tablo halinde listeler.
Özet – Yeast One Hybrid vs Yeast Two Hybrid
Maya bir hibrit ve maya iki hibrit, in vitro temelli iki önemli testtir. Maya bir hibrid, DNA ve protein etkileşimlerini analiz etmek için in vitro tabanlı bir tahlilken, maya iki hibrit, protein ve protein etkileşimlerini analiz etmek için in vitro tabanlı bir tahlildir. Bu nedenle, maya bir hibrit ve maya iki hibrit arasındaki temel fark budur.
