Ksilen siyanol ve bromofenol mavisi arasındaki temel fark, %1 agaroz jelde ksilen siyanolün daha yavaş, bromofenol mavisinin daha hızlı göç etmesidir.
Ksilen siyanol ve bromofenol mavisi, agaroz jel elektroforezi ve poliakrilamid jel elektroforezi sürecinin izlenmesinde kullanılabilen renk belirteçleri olarak önemlidir.
Ksilen Siyanol Nedir?
Ksilen siyanol, elektroforetik bir renk işaretleyici veya bir izleme boyasıdır. Agaroz jel elektroforezi ve poliakrilamid jel elektroforezi sürecinin izlenmesinde faydalıdır. Bu madde numune ile karıştırıldığında, bu maddenin konsantrasyonu tipik olarak yaklaşık 0 olur.%005 ila %0.03. Ksilen siyanol için kullanabileceğimiz bazı eş anlamlılar arasında Asit Mavisi 147, ksilen siyanol, ksilen siyanol FF, ksilen siyanol FF vb. bulunur.
Bu bileşiğin kimyasal formülü C25H27N2NaO 6S2 Ksilen siyanolün molar kütlesi 538.61 g/mol'dür. Bu madde, %1 agaroz jellerde yaklaşık 4 – 5 kilobaz çiftli DNA fragmanı oranında göç edebilir. Ancak, bu kullandığımız arabelleğe bağlıdır. Tipik olarak, %6 poliakrilamid jel üzerindeki ksilen siyanol, yaklaşık 140 baz çift DNA parçası hızında göç edebilir. Öte yandan, %20 denatüre poliakrilamid jel elektroforezinde 25 baz oligonükleotit oranında göç edebilir.
Ksilen siyanolün hidrojen bağı verici sayısı 2m ve hidrojen bağı alıcı sayısı 8'dir. Bu bileşiğin dönebilir bağ sayısı 7 olarak verilebilir. Ksilen siyanolün karmaşıklığı 1120 derece olarak tanımlanabilir. 1, olarak tanımlanmış bir bağ stereomerkezi sayısına sahiptir.
Bromofenol Mavisi Nedir?
Bromofenol mavisi, elektroforetik bir renk belirteci ve boya olarak yararlı olan kullanışlı bir pH göstergesidir. Kimyasal adı 3', 3", 5', 5"-tetrabromophenolsulfonphthalein, BPB'dir. Bu bileşiğin kimyasal formülü C19H10Br4O5 şeklindedir. S. Bu bileşiğin molar kütlesi 669.96 g/mol'dür. Kokusuzdur ve yoğunluğu 2,2 g/mL olarak verilebilir. Erime noktası 273 santigrat derece ve kaynama noktası 279 santigrat derecedir. Buzul asetik asit içindeki sıcak bir fenolsülfonftalein çözeltisine yavaş yavaş fazla brom ekleyerek hazırlayabiliriz.
Bromofenol mavisi, pH 3,0 ila 4,6 aralığında bir asit-baz göstergesi olarak kullanışlıdır. pH 3.0'da sarıdan pH 4.6'ya değişebilir. Ayrıca, geri dönüşümlü bir reaksiyondur. Yapısal olarak bromofenol mavisi, fenolftaleine benzer.
Ayrıca, agaroz jel elektroforezi ve poliakrilamid jel elektroforezi sürecini izlemek için bir renk belirteci olarak kullanabiliriz. Bu madde, bir jelde DNA veya protein ile aynı yönde göç edebileceği orta pH'da negatif bir yük taşıyabilir. Göç oranı jel yoğunluğuna ve tampon bileşimine göre değişebilir. Bununla birlikte, 1 kez TAE tamponu veya TBE tamponu içindeki tipik bir %1 agaroz jelde, bu madde yaklaşık 300 baz çiftinden oluşan bir DNA fragmanı ile aynı hızda göç eder.
Ksilen Siyanol ve Bromofenol Mavisi Arasındaki Fark Nedir?
Ksilen siyanol ve bromofenol mavisi önemli renk belirteçleridir. Ksilen siyanol ve bromofenol mavisi arasındaki temel fark, %1 agaroz jelde ksilen siyanolün daha yavaş, bromofenol mavisinin daha hızlı göç etmesidir.
Aşağıda, yan yana karşılaştırma için tablo biçiminde ksilen siyanol ve bromofenol mavisi arasındaki farkın bir özeti bulunmaktadır.
Özet – Ksilen Siyanol ve Bromofenol Mavisi
Ksilen siyanol ve bromofenol mavisi, agaroz jel elektroforezi ve poliakrilamid jel elektroforezi sürecinin izlenmesinde kullanılan renk belirteçleri olarak önemlidir. Ksilen siyanol ve bromofenol mavisi arasındaki temel fark, %1 agaroz jelde ksilen siyanolün daha yavaş, bromofenol mavisinin daha hızlı göç etmesidir.
