De novo ve kurtarma yolu arasındaki temel fark, pürin nükleo titlerinin de novo sentezinin fosforiboz, amino asitler, CO2 vb. gibi küçük molekülleri kullanan süreci ifade etmesidir. pürin nükleo titleri üretmek için ham maddeler olarak kullanılırken, pürin sentezinin kurtarma yolu, pürin nükleo titleri üretmek için pürin bazları ve pürin nükleozidleri kullanan süreci ifade eder.
Nükleo titler, nükleik asitlerin yapı taşlarıdır. Ayrıca bazı nükleotidler, özellikle ATP, enerji transferinde önemli bir role sahiptir. Bazıları ikincil haberciler olarak da çalışır. Bir nükleotidin üç bileşeni vardır: şeker, azot bazı ve fosfat grubu. Nükleo titlerin sentezi farklı yollarla gerçekleşir. De novo yolu ve kurtarma yolu, pürin nükleo titlerinin sentezinin iki ana yoludur. De novo yolu, ana yol olarak işlev görürken, kurtarma yolu, beyin ve kemik iliğinde pürin nükleotid sentezi için önemlidir. Bu nedenle, de novo yolu büyük bir yoldur, kurtarma yolu ise küçük bir yoldur.
De Novo Pathway nedir?
De novo yolu, küçük moleküllerle başlayan ve yeni karmaşık molekülleri sentezleyen metabolik bir yoldur. Bu nedenle, pürin nükleo titlerinin de novo sentezi, pürin nükleo titlerini üretmek için küçük molekülleri kullanan süreci ifade eder. Purin nükleotidlerini sentezlemek için fosforiboz, amino asitler (glutamin, glisin ve aspartat), CO2,vb. gibi ham maddeleri kullanır. Ayrıca, de novo yol, pürin nükleotidlerini sentezleyen ana yoldur.
Şekil 01: Purin Nükleotidlerinin De Novo Sentezi
De novo yolda, riboz -5-fosfat başlangıç malzemesi olarak çalışır. Daha sonra ATP ile reaksiyona girerek fosforibosil pirofosfata (PRPP) dönüşür. Daha sonra glutamin, amid grubunu PRPP'ye bağışlar ve onu 5-fosforibosilamine dönüştürür. Daha sonra 5-fosforibosilamin glisin ile reaksiyona girer ve glisinamid ribosil 5-fosfat olur ve daha sonra formilglisinamid ribosil 5-fosfata dönüşür. Glutamin, amid grubunu bağışlar ve formilglisinamid ribosil 5-fosfatı formilglisinamidin ribosil 5-fosfata dönüştürür. Daha sonra pürinin imidazol halkası halka şeklini tamamlar. Son olarak, CO2 eklenmesi ve birkaç başka reaksiyon geçirmesi ile inosin monofosfat (IMP) haline gelir. IMP, pürin nükleo titleri olan adenosin monofosfat (AMP) ve guanozin monofosfatın (GMP) hemen öncü molekülüdür.
Kurtarma Yolu Nedir?
Pürin nükleotid sentezinin kurtarma yolu, pürin bazlarından ve pürin nükleositlerinden nükleotidlerin sentezlenmesi sürecini ifade eder. Pürin bazları ve pürin nükleo titleri, polinükleotit parçalanması gibi nükleo titlerin metabolizmasının bir sonucu olarak hücrelerde sürekli olarak üretilir. Üstelik bu bazlar ve nükleositler de vücudumuza tükettiğimiz besinlerle girer.
Şekil 02: De Novo ve Kurtarma Yolu
Pürin nükleotid sentezinin kurtarma yolu küçük bir yoldur. Esas olarak fosforibosiltransferaz reaksiyonu ile oluşur. İki spesifik enzim, adenin fosforibosil transferaz (APRT) ve hipoksantin-guanin fosforibosil transferaz (HGPRT), fosforibosiltransferaz reaksiyonunu katalize eder. Pürin nükleotidlerini vermek için riboz-5'-fosfat kısmının fosforibosil pirofosfattan (PRPP) purin bazlarına transferini katalize ederler. Kurtarma yolu, de novo sentezin mümkün olmadığı bazı dokularda önemlidir.
De Novo ve Kurtarma Yolu Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- De novo ve kurtarma, nükleotid sentezinin iki yoludur.
- Ayrıca, her ikisi de DNA için deoksiribonükleo titleri sentezlemek için kullanılabilen ribonükleo titleri birleştirir.
- Ayrıca, geribildirim inhibisyonu her iki yolu da düzenler.
De Novo ile Kurtarma Yolu Arasındaki Fark Nedir?
Nükleotid sentezi iki yolla gerçekleşir: de novo yol ve kurtarma yolu. De novo yolu, nükleotidler üretmek için küçük moleküller kullanırken, kurtarma yolu, nükleotidler üretmek için önceden oluşturulmuş bazları ve nükleositleri kullanır. Bu, de novo ve kurtarma yolu arasındaki temel farktır.
Ayrıca, de novo ve kurtarma yolu arasındaki bir diğer önemli fark, de novo yolunun tüm hücre tiplerinde gerçekleşmesi, kurtarma yolunun ise de novo işleminin mümkün olmadığı belirli dokularda gerçekleşmesidir. Ayrıca, de novo yolu ana yoldur, kurtarma yolu ise nükleotid sentezinin küçük bir yoludur.
Aşağıdaki bilgi grafiği, de novo ve kurtarma yolu arasındaki başka bir farkla ilgili daha fazla karşılaştırma gösteriyor.
Özet – De Novo, Kurtarma Yoluna Karşı
De novo yolu, küçük moleküllerden yeni sentezlenen karmaşık bileşiklerin bir yoludur. Kurtarma yolu, karmaşık bileşikleri sentezlemek için önceden yapılmış bileşikleri kullanmanın bir yoludur. Nükleotid sentezinde hem de novo hem de kurtarma yolları görülür. Bu nedenle, pürin nükleotit sentezinin de novo yolu, yeni pürin nükleo titleri üretmek için riboz şekeri, amino asitler, CO2, bir karbon ünitesi vb. gibi küçük molekülleri kullanan süreci ifade eder. Öte yandan, pürin nükleotit sentezinin kurtarma yolu, purin nükleo titleri üretmek için önceden yapılmış bazları ve nükleositleri kullanan süreci ifade eder. Bu nedenle, de novo ve kurtarma yolu arasındaki temel fark budur. Ayrıca, tüm hücre tipleri de novo yolu yürütme yeteneğine sahipken, yalnızca belirli dokular kurtarma yolunu gerçekleştirebilir.
