Yalpalama ve yozlaşma arasındaki temel fark, yalpalamanın, mRNA ile tRNA arasındaki kodon ve antikodon bağlanması sırasında Watson olmayan ve crick eşleşmesini açıklayan hipotezi ifade etmesidir. Bu arada, kodonun dejenerasyonu, birden fazla kodondan tek bir amino asit üretme yeteneğidir.
Moleküler biyolojinin merkezi dogması, fonksiyonel proteinlerin ifadesinin gerçekleştiği süreci açıklar. Ve bu süreç, genetik materyalin replikasyonunu takiben DNA dizisinin mRNA dizisine transkripsiyonu ve mRNA dizisinin bir amino asit dizisine çevrilmesi de dahil olmak üzere farklı adımlardan oluşan bir dizidir.
Çeviride, yalpalama hipotezi ve kodonun yozlaşması kavramları önemli roller oynar. Wobble, tek tRNA'nın birden fazla kodonu tanıma yeteneğini ifade eder. Kodonların dejenerasyonuna yol açar. Dejenerasyon, bir amino asidin birden fazla kodon tarafından belirlenebildiği fenomendir. Basit bir deyişle, dejenerasyon, tek bir amino asit için birden fazla kodun varlığına atıfta bulunur.
Wobble nedir?
Yalpalama hipotezi, çeviri işlemi sırasında gerçekleşen Watson Crick dışı baz eşleşmesini açıklayan önemli bir hipotezdir. Burada çeviri, mRNA kodonunu bir amino asit dizisine dönüştüren moleküler süreçtir. Bu hipoteze göre, tRNA antikodonunun ilk bazı, Watson ve Crick olmayan eşleşme modeli ile mRNA zincirindeki kodonun üçüncü bazı ile eşleşme yeteneğine sahiptir. Bu nedenle, geleneksel adenin-urasil bağlama veya sitozin-guanin bağlama modellerini takip etmezler. Antikodonun 1. tabanının ve kodonun 3. tabanının yalpalama modeli olarak bilinir.
Şekil 01: Wobble Taban Eşleştirme
Yalpalama eşleşmeleri, urasil yerine Adenin ve inosin eşleşmesini içerir. Urasil, Adenin, Guanin ve İnozin ile eşleşir. Benzer şekilde, Guanin ve sitozin de inozin ile eşleşme yeteneğine sahiptir. Bu nedenle, tRNA'daki inosin, yalpalama baz eşleşmesine maruz kalan olağandışı bazlardan biridir.
Yalpalama baz çifti bağlaması, Watson ve Crick'in tamamlayıcı bağlamasını izlemesi gerekmediğinden daha az güçlüdür. Ayrıca bu kavram, genetik kodun yozlaşması ilkesine yol açar.
Yozlaşma Nedir?
Genetik kodun yozlaşması, genetik kodun fazlalığı anlamına gelir. Bu nedenle, tek bir amino asidi belirleyen birçok baz çifti kombinasyonu olabilir. Genel olarak, organizmaların kodonu üç nükleotid bazından oluşur. Dejenerasyon kavramında, bu üç baz kombinasyonu, aynı amino asidi meydana getirmelerine rağmen değişebilir. Ayrıca doğada sadece 20 amino asit olmasına rağmen 20'den fazla kodon bulunmaktadır. Bu nedenle dejenerasyon, belirli bir amino asit için çoklu kodonların varlığını açıklar.
Şekil 02: Dejenerasyon
Yozlaşmada üçüncü baz iki kodon arasında değişebilir. Böylece, glutamik asit hem GAA hem de GAG kodonları tarafından belirtilirken lösin, UUA, UUG, CUU, CUC, CUA ve CUG kodonları tarafından belirtilir.
Bu nedenle mutasyon oranlarında dejenerasyon kavramı çok önemlidir. Bu nedenle, genomda meydana gelen nokta mutasyonları tolere edilebilir ve yine de susturulmuş gibi görünür. Bu nedenle, bu tip nokta mutasyonları, amino asit sekansında bir mutasyon veya değişiklik ile sonuçlanmaz. Ancak nokta mutasyonları, kodlanan amino asidin değişmesine yol açarsa, ciddi genotipik ve fenotipik değişikliklere neden olabilir.
Yalpalama ve Yozlaşma Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Her ikisi de çeviri süreciyle ilgili olarak hayatın temel dogmasını açıklamak için ileri sürülen önemli hipotezlerdir.
- Ayrıca, her iki işlem de üç baz çifti kodon dilini 20 amino asit dizisine çevirmede önemli bir rol oynar.
- Bu süreçler aynı zamanda organizmaların evrimsel kalıplarına da yardımcı olur.
Yalpalama ve Yozlaşma Arasındaki Fark Nedir?
Yalpalama ve yozlaşma arasındaki temel fark, öncelikle yalpalamanın genetik kodun yozlaşmasına yol açmasıdır. Titreşim, kodonun 3rd tabanı ile antikodon'un 1st tabanı arasındaki Watson ve Crick dışı eşleşmenin izlenmesi anlamına gelir. Buna karşılık, dejenerasyon, birçok üçlü kodon kombinasyonunun tek bir amino asidi kodlama yeteneğidir.
Aşağıdaki infografik, yalpalama ve yozlaşma arasındaki farkı özetler.
Özet – Wobble vs Dejenerasyon
Wobble hipotezi ve genetik kodun yozlaşması, çeviri fenomeninde iki önemli kavramdır. Burada çeviri, üçlü kodonları amino asitlere dönüştürme işlemidir. Kodonun antikodona bağlanmasında Watson ve Crick olmayan baz eşleşmesinin keşfi, yalpalama hipotezini ifade eder. Kodon ve antikodon arasındaki bazların sallanması bununla açıklanır. Buna karşılık, yalpalama işlemiyle sonuçlanan genetik kodun dejenerasyonu, tek bir amino asidin birçok farklı kodon tarafından kodlandığı fenomendir. İşte yalpalama ve yozlaşma arasındaki farkın özeti bu.